Eu uso Thunderbird e seu sobrinho SeaMonkey. No trabalho e no pen eu uso o Thunderbird com a opção marcada "Manter mensagens no servidor" ou "Leave messages on the server". Quando chego em casa e quero limpar o e-mail de vez para não encher, eu descarrego tudo com o SeaMonkey, e deixo nele desmarcado esta opção. Ele baixa tudo novamente mas limpa a caixa de e-mail funcional. E ainda o uso como depósito para as mensagens mais importantes e até como backup.
É isto aí!