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Ao mesmo tempo em que o usuário está compartilhando arquivos, ele pode também estar compartilhando informações sobre ele e seu computador. Diversos softwares oferecidos gratuitamente vêm com pragas espiãs que registram os tipos de arquivos buscados ou roubam identidade. Outra desvantagem das redes P2P é que elas facilitam a entrada de programas maliciosos.

Algumas dessas pragas analisam as preferências do usuário e em seguida lhe oferecem arquivos que provavelmente lhe interessam, mas estão comprometidos.

Com milhares de usuários cadastrados, é complicado garantir a origem e a confiabilidade do conteúdo que está sendo baixado. Invasores aproveitam essa fragilidade para camuflar vírus com nomes de músicas, cantores, bandas e filmes com muita visibilidade no momento ou palavras relacionadas a fatos de interesse público. 

Se você não quer correr nenhum risco de infectar seu computador, é melhor não recorrer a nenhum desses serviços. Os filtros de segurança não costumam ser absolutamente eficazes e ainda não há forma infalível de determinar a integridade dos arquivos.